מחקרים רבים הצביעו על כך שמתן אוטונומיה לבתי הספר עשוי להשפיע לטובה על  הישגי התלמידים, אך מצד שני, היא עשויה להרחיב את הפערים ולהגדיל את אי השוויון: במקרים רבים, בתי הספר החזקים קידמו את התלמידים שלהם בעזרת האוטונומיה שניתנה להם, ואילו החלשים לא פעלו נכון, והפערים התרחבו. 

מה נדרשת לעשות מערכת חינוך, במקביל למתן האוטונומיה, כדי לסייע לצמצום פערים?

המחקר מצביע על מספר דגשים:
 

• להגדיר כיעד מרכזי את צמצום הפערים הלימודיים ומתן הזדמנויות שוות - במקביל להגדלת האוטונומיה  
   

• ללוות ולפקח אחר פעילות בתי הספר האוטונומיים ולבחון את מידת צמצום הפערים בדרכים מגוונות (לא רק מבחנים סטנדרטיים)
   

• לצמצם תחרות בין בתי הספר, ולא לתמרץ בתי ספר על הישגים (בשילוב מתן אוטונומיה, עלול לעודד קבלה רק של תלמידים חזקים)
   

• לעודד ולתמרץ שיתופי פעולה בין בתי הספר, בהובלת פרויקטים משותפים, ושיתוף הדדי בידע מקצועי
   

• לתקצב באופן דיפרנציאלי ולתת הזדמנות שווה אמיתית לבתי ספר המשרתים תלמידים מרקע סוציואקונומי נמוך